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A universal language for finding mass spectrometry data patterns

Damiani, T., Jarmusch, A., Aron, A., Petras, D., Phelan, V., Zhao, H., Bittremieux, W., Acharya, D., Ahmed, M., Bauermeister, A., Bertin, M., Boudreau, P., Borges, R., Bowen, B., Brown, C., Chagas, F., Clevenger, K., Correia, M., Crandall, W., Crüsemann, M., Fahy, E., Fiehn, O., Garg, N., Gerwick, W., Gilbert, J., Globisch, D., Gomes, P. W. P., Heuckeroth, S., James, C., Jarmusch, S., Kakhkhorov, S., Kang, K. B., Kessler, N., Kersten, R., Kim, H. W., Kirk, R., Kohlbacher, O., Kontou, E., Liu, K., Lizama-Chamu, I., Luu, G., Luzzatto Knaan, T., Mannochio-Russo, H., Marty, M., Matsuzawa, Y., McAvoy, A., McCall, L.-I., Mohamed, O., Nahor, O., Neuweger, H., Niedermeyer, T., Nishida, K., Northen, T., Overdahl, K., Rainer, J., Reher, R., Rodriguez, E., Sachsenberg, T., Sanchez, L., Schmid, R., Stevens, C., Subramaniam, S., Tian, Z., Tripathi, A., Tsugawa, H., van der Hooft, J., Vicini, A., Walter, A., Weber, T., Xiong, Q., Xu, T., Pluskal, T., Dorrestein, P., and Wang, M. A universal language for finding mass spectrometry data patterns. Nature Methods (Nat. Methods) 22, 1247–1254, 2025. https://doi.org/10.1038/s41592-025-02660-z